Nesta parte do seu codigo:
var nome = prompt("Informe seu nome");
var alturaInformada = prompt (nome + ", informe sua altura");
var pesoInformado = prompt (nome + ", informe seu peso")
var imc = calculaImc(alturaInformada, pesoInformado);
Sempre que voce quiser ler um valor passado pelo usuario pelo prompt voce deve transformar a string em um valor inteiro utilizando o parseInt ou para numeros com casas decimais utilizar o parseFloat.
var nome = prompt("Informe seu nome");
var alturaInformada = parseFloat((prompt (nome + ", informe sua altura"));
var pesoInformado = parseFloat((prompt (nome + ", informe seu peso"));
var imc = calculaImc(alturaInformada, pesoInformado);