Oi Wendell,
entre a comunidade ágil não vemos mais grandes preocupações em certificações de Scrum, já que elas avaliam apenas o conhecimento teórico do profissional e, bom... sabemos que o que realmente importa para Scrum Masters é a vivência com times e a aplicação dos conceitos.
Dito isso, se você ainda quiser tirar uma certificação, não há preferência sobre uma ou outra. Apenas, para a certificação da Scrum.org, você estuda o conteúdo do Scrum Guide, faz os Open Assessments e aí faz a prova online. Enquanto isso, para a Scrum Alliance, é preciso fazer um curso presencial de 16h com um CST (Certified Scrum Trainer) para chegar à prova. Se esse for o caso, recomendo fazê-lo com o Alexandre Magno (Adaptworks) que, entre outros vários méritos, é o keynote speaker nacional da Agile Brazil desse ano. :-)
Aliás, ir à conferência pode ser uma excelente oportunidade de conhecer mais a comunidade ágil, aprender um bocado e trocar informações: www.agilebrazil.com
Em tempo, obrigada pelos elogios ao curso! Fico bem feliz!