Olá Rafael, favor desconsiderar os últimos logs, não havia informado a senha de root do mysql.
Ainda assim, banco owasp não foi criado. Console do tomcat:
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: Server version: Apache Tomcat/8.5.4
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: Server built: Jul 6 2016 08:43:30 UTC
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: Server number: 8.5.4.0
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: OS Name: Linux
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: OS Version: 4.4.0-101-generic
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: Architecture: amd64
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: Java Home: /usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: JVM Version: 1.8.0_151-b12
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: JVM Vendor: Oracle Corporation
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: CATALINA_BASE: /media/mario/tempnew/Workspace-Eclipse/eclipse-jee-oxygen-1a-x86_64/.metadata/.plugins/org.eclipse.wst.server.core/tmp1
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: CATALINA_HOME: /opt/apache-foundation/apache-tomcat-8.5.4
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: Command line argument: -Dcatalina.base=/media/mario/tempnew/Workspace-Eclipse/eclipse-jee-oxygen-1a-x86_64/.metadata/.plugins/org.eclipse.wst.server.core/tmp1
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: Command line argument: -Dcatalina.home=/opt/apache-foundation/apache-tomcat-8.5.4
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: Command line argument: -Dwtp.deploy=/media/mario/tempnew/Workspace-Eclipse/eclipse-jee-oxygen-1a-x86_64/.metadata/.plugins/org.eclipse.wst.server.core/tmp1/wtpwebapps
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: Command line argument: -Djava.endorsed.dirs=/opt/apache-foundation/apache-tomcat-8.5.4/endorsed
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.startup.VersionLoggerListener log
INFORMAÇÕES: Command line argument: -Dfile.encoding=UTF-8
dez 03, 2017 2:05:11 PM org.apache.catalina.core.AprLifecycleListener lifecycleEvent
INFORMAÇÕES: The APR based Apache Tomcat Native library which allows optimal performance in production environments was not found on the java.library.path: /usr/java/packages/lib/amd64:/usr/lib64:/lib64:/lib:/usr/lib