Oi André, desculpa. Acabou não indo o código.
Segue:
<canvas width="600" height="400"></canvas>
<script>
    function desenhaBandeiraBrasil() {
        var tela = document.querySelector('canvas');
        var pincel = tela.getContext('2d');
        pincel.fillStyle="green";
        pincel.fillRect(0, 0, 600, 400);
        pincel.fillStyle="yellow";
        pincel.beginPath();
        pincel.moveTo(300, 50);
        pincel.lineTo(50, 200);
        pincel.lineTo(550, 200);
        pincel.fill();
        pincel.beginPath();
        pincel.moveTo(50, 200);
        pincel.lineTo(300, 350);
        pincel.lineTo(550, 200);
        pincel.fill();
        pincel.fillStyle="darkblue";
        pincel.beginPath();
        pincel.arc(300, 200, 100, 0, 2* 3.14);
        pincel.fill();
    }
    function desenhaBandeiraAlemanha() {
        var tela = document.querySelector('canvas');
        var pincel = tela.getContext('2d');
        pincel.fillStyle = 'black';
        pincel.fillRect(0, 0, 600, 133);
        pincel.fillStyle = 'red';
        pincel.fillRect(0, 133, 600, 133);
        pincel.fillStyle = 'yellow';
        pincel.fillRect(0, 266, 600, 133);
    }
var mostraBrasil = true;
   function trocaBandeira() {
        if(mostraBrasil == true) {
            desenhaBandeiraBrasil();
        } else {
            desenhaBandeiraAlemanha();
        }
        mostraBrasil = !mostraBrasil;
    }
    setInterval(trocaBandeira, 3000);
</script>