Fala, Djavan
Tudo bem?
Para desativar a criação de uma nova camada quando desenhar com a caneta confirme se está habilitada a opção Shape no menu da ferramenta (canto superior esquerdo ao lado do ícone da caneta) e troque para Path. Shape gera uma forma geométrica atrelada a uma camada, enquanto Path cria um caminho de vetor (visualizável na aba Paths ao lado da aba Layers).
Espero ter te ajudado. Se tiver mais alguma dúvida, fique à vontade.
Abraços e bons estudos