Caro Maciel,
Pela descrição da função que você nos passou envolvendo integrações - o que demanda análise de requisitos, nos parece mais indicado você utilizar o CNAE: 62.01-5/01 - Desenvolvimento de programas de computador sob encomenda.
Além disso, se em algum momento você perceber que está atuando mais como analista de negócios do que desenvolvedor use o CNAE: 62.04-0/00 - Consultoria em tecnologia da informação.
Lembre-se o que citamos acima é só uma sugestão, nada impede de você usar outro CNAE e ou mudá-lo no futuro, ok?
No mais te desejamos muito sucesso na sua carreira e conte conosco para reforçar sua capacitação para os desafios do mercado!