Boa tarde Eliezer,
Uma correção possível seria começar a sua contagem a partir de 2. Assim:
var limite = 100
var numero = 2;
Uma outra solução seria utilizar o resto da operação de divisão por 2 e garantir que o número seja maior que zero. Talvez essa solução seja um pouco complexa demais nesse ponto, portanto senão entender alguma coisa não se preocupe, provavelmente será ensinado nas próximas aulas:
<meta charset="UTF-8">
<script>
function pula() {
document.write("<br><br>");
}
function mostra(frase) {
document.write(frase);
pula();
}
var limite = 100
var numero = 0;
while(numero <= limite) {
if (numero % 2 === 0 && numero > 0) {
mostra(numero);
}
numero = numero + 2;
}
mostra("FIM");
</script>
Abraços