Olá Laissa! O problema deste código não está diretamente na tag, mas sim na forma como a função foi escrita, pois primeiramente você declarou ela como pulalinha() com o L do linha minúsculo e depois chamou a função pulaLinha com o L do linha maiúsculo, nesse caso teria que consertar como a função foi declarada ou como ela foi chamada, a tag não está funcionando pois ela está apenas dentro da função, e a função em si não está sendo chamada.
Ficaria assim:
<meta charset="UTF-8">
<script>
function pulaLinha() {
document.write("<br>");
}
function mostra(frase) {
document.write(frase);
}
var minhaIdade = 16
var idadeAna = 25
var idadeBruna = 29
mostra("Nossa diferença de idade é " + (minhaIdade - idadeAna));
pulaLinha();
mostra("Nossa diferença de idade é" + (minhaIdade - idadeBruna));
pulaLinha();
</script>