Oi Evandro Vieira Silva a função Math.round retorna um valor inteiro, ou seja ela descarta a parte decimal se você utilizar ela da forma como você está utilizando, somente para a média o valor retornado sempre será inteiro.
No entanto se você utilizar ela antes da divisão ainda preservará a parte decimal o código ficaria assim:
<meta charset="UTF-8">
<script>
var idadeLinda = 12;
var idadeGuaraciara = 15;
var idadePerola = 13;
var media = (Math.round(idadeLinda + idadePerola + idadeGuaraciara)/3);
document.write ("A idade média das crianças é: " + media);
</script>
Além disso se você quiser definir a quantidade de casas decimais tem a função toFixed. A implementação é bem simples basta passar a quantidade de casas decimais que queremos:
<meta charset="UTF-8">
<script>
var idadeLinda = 12;
var idadeGuaraciara = 15;
var idadePerola = 13;
var media = (Math.round(idadeLinda + idadePerola + idadeGuaraciara)/3);
document.write ("A idade média das crianças é: " + media.toFixed(2));
</script>
Espero ter ajudado e bons estudos.