Fiz uns ajustes a mas para incrementar a saida do resultado de acordo com os dados de entrada o if compara se é maior ou menor o IMC e exibe a mensagem logo apos o resultado . pode tambem inserir o prompt + alert para perguntar ao usuario a altura e o peso e depois calcular fiz de maneira mas simplificada possivel.
<meta charset="UTF-8">
<script>
function pulaLinha() {
document.write("<br>");
}
function mostra(frase) {
document.write(frase);
pulaLinha();
}
function calculaImc(altura, peso) {
var imc = peso / (altura * altura);
return imc;
}
var imcFlavio = calculaImc(1.71, 63);
var imcInacio = calculaImc(1.72, 68);
mostra("Imc do Flavio " + Math.round(imcFlavio));
mostra("Imc do Amigo " + Math.round(imcInacio));
pulaLinha();
if (imcFlavio > imcInacio ) {
pulaLinha();
mostra("<b> o flavio esta com imc mas alto do que o Inacio . ");
}
else {mostra("O Inacio esta com o imc mas alto que o Flavio.!!</b>")
}
</script>