Olá Pedro,

Posta aqui o código completo da classe FormularioActivity e também da FormularioHelper. Além disso, copia aqui também a mensagem de erro que aparece no console do Android Studio quando a app fecha. Assim a gente consegue ter uma ideia melhor do que pode estar causando o problema.

1- Helper 2- Activity 3- Mensagem de erro: "Unfortunately, Agenda has stopped."

package com.example.peduboy.agenda;


import android.widget.EditText;
import android.widget.RatingBar;

import com.example.peduboy.agenda.modelo.Aluno;

public class FormularioHelper {
    private final EditText camponome;
    private final EditText campoendereço;
    private final EditText campofone;
    private final EditText camposite;
    private final RatingBar camponota;

    private Aluno aluno;

    public FormularioHelper(FormularioActivity activity) {
        camponome = (EditText) activity.findViewById(R.id.formulario_nome);
        campoendereço = (EditText) activity.findViewById(R.id.formulario_endereço);
        campofone = (EditText) activity.findViewById(R.id.formulario_telefone);
        camposite = (EditText) activity.findViewById(R.id.formulario_site);
        camponota = (RatingBar) activity.findViewById(R.id.formulario_nota);
        aluno = new Aluno();
    }

    public Aluno pegaAluno() {
        aluno.setNome(camponome.getText().toString());
        aluno.setEndereço(campoendereço.getText().toString());
        aluno.setTelefone(campofone.getText().toString());
        aluno.setSite(camposite.getText().toString());
        aluno.setNota(Double.valueOf(camponota.getProgress()));
        return aluno;
    }

    public void preencheFormulario(Aluno aluno) {
        camponome.setText(aluno.getNome());
        campoendereço.setText(aluno.getEndereço());
        campofone.setText(aluno.getTelefone());
        camposite.setText(aluno.getSite());
        camponota.setProgress(aluno.getNota().intValue());
        this.aluno = aluno;
    }
}

package com.example.peduboy.agenda;

import android.content.Intent;
import android.os.Bundle;
import android.support.v7.app.AppCompatActivity;
import android.view.Menu;
import android.view.MenuInflater;
import android.view.MenuItem;
import android.widget.Toast;

import com.example.peduboy.agenda.dao.AlunoDAO;
import com.example.peduboy.agenda.modelo.Aluno;

public class FormularioActivity extends AppCompatActivity {
    private FormularioHelper helper;

    @Override
    public void onCreate(Bundle savedInstanceState) {
        super.onCreate(savedInstanceState);
        setContentView(R.layout.activity_formulario);
        Intent intent = getIntent();
        Aluno aluno = (Aluno) intent.getSerializableExtra("aluno");
        if (aluno != null) {
            helper.preencheFormulario(aluno);
        }
        helper = new FormularioHelper(this);
    }

    @Override
    public boolean onCreateOptionsMenu(Menu menu) {
        MenuInflater inflater = getMenuInflater();
        inflater.inflate(R.menu.menu_formulario, menu);
        return super.onCreateOptionsMenu(menu);
    }

    @Override
    public boolean onOptionsItemSelected(MenuItem item) {
        switch (item.getItemId()) {
            case R.id.menu_formulario_ok:
                Aluno aluno = helper.pegaAluno();
                AlunoDAO dao = new AlunoDAO(this);
                if (aluno.getId() != null) {
                    dao.altera(aluno);
                } else {
                    dao.insere(aluno);
                }
                dao.close();

                Toast.makeText(FormularioActivity.this, "Aluno Salvo!", Toast.LENGTH_SHORT).show();
                finish();
                break;
        }
        return super.onOptionsItemSelected(item);
    }
}

se eu tirar a função de preencher

if (aluno != null) {
            helper.preencheFormulario(aluno);
        }

o app funciona normal, porém o formulário vem em branco e cadastraria outra pessoa, um novo id

Legal Pedro, dá uma olhada nessa parte do código da FormularioActivity:

        if (aluno != null) {
            helper.preencheFormulario(aluno);
        }
        helper = new FormularioHelper(this);

Percebe que estamos tentando utilizar o helper antes de criá-lo?

O correto aqui seria primeira fazer o new FormularioHelper antes do if e depois sim fazer o if e chamar o preencheFormulario(...).

Tenta fazer essa mudança pra ver se funciona!

muito obrigado