Oi, Henrique. No lugar dos elses que vc havia colocado a cima nos códigos, adicionei o elif, assim o programa irá funcionar e já que ele terá 3 opções diferente, agora ele lerá essas opções.
usuario = input("Informe o usuário do sistema!")
if(usuario == "Flávio"):
print("Seja bem-vindo Flávio!")
elif(usuario == "Douglas"):
print("Seja bem-vindo Douglas!")
elif(usuario == "Nico"):
print("Seja bem-vindo Nico")
else:
print("Usuário não identificado!")