Vou deixar meu problema relatado aqui, caso alguém passe pelo mesmo sufoco.
Sempre que eu executava o comando abaixo dentro da pasta "C:\kafka" eu recebia a mensagem de erro: A sintaxe do comando está incorreta
.\bin\windows\zookeeper-server-start.bat .\config\zookeeper.properties
Segui todos os tutoriais que encontrei mas não adiantou.
Depois de muito procurar dentro dos arquivos zookeeper-server-start.bat e kafka-run-class.bat identifiquei que o problema estava na minha variável de ambiente %JAVA_HOME%. No meu caso o caminho do java possuía um aspas duplas (") no final. Bastou corrigir o caminho e o comando funcionou corretamente.
Espero que ajude.