Solucionado
Digamos que eu tenha mais lógicas referente a Empresa (adiciona, altera, busca, lista, remove...).
Seria possível eu colocar todas essas lógicas dentro de uma classe através de funções, e lá no meu controle poder instanciar essa classe e ainda chamar o método de acordo com a lógica que eu queira executar?
Você pode colocar as lógicas (métodos) dentro de uma classe e a partir do controle pode instanciar a classe e invocar o método desejado.
Isto é totalmente possível.
O ideal sempre é pensar nas responsabilidades (métodos) que cada classe deve possuir no projeto.
Não é legal ter classes que fazem muita coisa.